毎週日曜日 ９時１５分〜１０時１５分
普通は「日曜学校」や「教会学校」と呼ばれている、子供たちのためのキリスト教集会です。「聖書のお話が中心」ということを強調する意味で、神港教会では「聖書学校」と読んでいます。活動は会員によるボランティアで、どなたでも自由に出席できます。入学にお金はいりません。（礼拝の中で献金を集めますが、金額は自由です）
前半の３０分間は１階の会堂で礼拝をしています。聖書のお話を聞いて、こども賛美歌を歌います。
後半の３０分間は、学年に応じたクラスに分かれて分級を行います。
Aクラス：小学入学前 Bクラス：小学１年生〜３年生 Cクラス：小学４年生〜６年生